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實驗方法> DNA實驗技術> DNA原位雜交技術>Southern 雜交鑒定

Southern 雜交鑒定

關鍵詞: Southern 雜交 鑒定來源: 互聯(lián)網(wǎng)

1) 取10μl待測DNA,于一定濃度的瓊脂糖凝膠上進行電泳。(20mL,1.0%凝膠)

2) 凝膠用溴化乙錠染色,切掉凝膠四周多余部分,并在凝膠的一角作一記號, 拍照記錄電泳結果(拍照時, 凝膠旁放一尺子)。

3) 雜交用膠的制備 (做以下步驟兩組合一)

A. 將凝膠浸沒入30mL 0.25mol/L HCl溶液中15min,使DNA脫嘌呤。

B.用蒸餾水短暫洗凝膠2次。

C.將凝膠浸沒入30mL變性液中30min, 使凝膠變性。

D.將凝膠浸沒入30mL中和液中15min使它被中和。

重復D一次。在制備雜交用膠時準備轉移的平臺、膜、濾紙等(4、5)。

4) 準備DNA從凝膠向膜轉移的平臺

5) 將1張待用尼龍膜和3張厚濾紙切成與待轉移膠相同大小,并在尼龍膜一角做一標記。

另1張厚濾紙切成與凝膠相同寬度,長度(約18cm)足以達到轉移液盒子的底部。

準備10 X SSC 轉移液。

將待用尼龍膜用蒸餾水浸濕后,再浸入10 X SSC 轉移液中。

6)安裝毛細管轉移裝置

A.將長的濾紙放在轉移平臺的頂部,濾紙兩端達到轉移盒的底部,做成虹吸橋。

B.將8 0mL轉移液倒入轉移盒內(nèi),并濕潤濾紙。

C.將凝膠背面朝上置于濾紙搭成的橋上,凝膠與濾紙間避免有氣泡。

D.用保鮮紙封住凝膠四邊。

E.將浸濕的轉移膜置于凝膠的上部,凝膠與膜間避免有氣泡。

F.將剩下的3張濾紙小心的放在轉移膜的上面,并放一疊吸水紙搭在濾紙上,再放一玻璃板,其上壓一重物。

G.轉移幾小時或過夜(至少4小時)

注意:勿使轉移液干枯。

7)已轉移的DNA與膜交聯(lián)

A.將膜放在浸有10 X SSC的厚濾紙上,有DNA的一面朝上。

B.將膜置于UV crosslinker 中,在紫外光下自動交聯(lián)。

C.用蒸餾水短暫的漂洗已交聯(lián)的膜,空氣中干燥。

此膜可在4℃長期保存。

8)DNA探針的制備(略過)

參照生產(chǎn)商提供的實驗方法合成地高辛標記的探針。

9)印跡的預雜交

將適量的預雜交液DIG Easy Hyb在42 ℃預熱。

放入印跡膜,在42 ℃預雜交30min。

10)準備探針

水煮地高辛標記的探針5min使變性, 并立即放在冰上2min。

11) 加適量的探針到已預熱的雜交液中,混合均勻(避免形成泡沫,影響雜交效果)。

42 oC雜交至少4小時或過夜。

注意: 不要將探針直接加在印跡膜上,而應加在容器一角的預雜交液中。

12)印跡膜的沖洗:

A.將雜交液倒出,儲存起來可再次使用。

B. 用25mL的2 X SSC,0.1% SDS 在室溫搖動洗膜2次,每次5min 。

C. 用已預熱的30mL 0.5XSSC,0.1%SDS 在65 oC搖動洗膜2次,每次15min (用雜交爐)。

13)免疫檢測:

A. 用10mL沖洗液洗膜1-5min。

B. 膜在15mL阻斷液中孵育30min 。

C. 膜和8mL抗體孵育30min。

D. 在15mL沖洗液中洗膜2次,每次15min。

E. 在15mL檢測液中平衡2-5min。

14)將膜的有DNA的面朝上,放在保鮮紙上,滴數(shù)滴CSPD ready-to-use 覆蓋膜; 然后,立即用保鮮紙包裹, 擠掉多余的CSPD ready-to-use,使其均勻平鋪在膜上,沒有氣泡, 但避免使膜干掉. 室溫孵育5min。

15)在37 ℃孵育潮濕的膜10min,增強發(fā)光。

16)用X-光底片將雜交膜進行曝光10-25min.(發(fā)光性能至少可持續(xù)48小時)。

17) X-光底片的沖洗。

Agfa 30顯影液顯影(1-5min)---沖水(1min)---F5定影液定影(10min)---用水沖洗---晾干底片。

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