Ultima Genomics聯合英偉達挑戰基因測序巨頭
測序技術新人 Ultima Genomics 近日表示，它已與英偉達合作以加速基因組分析。
總部位于加利福尼亞州紐瓦克的 Ultima 一周前從隱身模式中脫穎而出，獲得了 6 億美元的資金支持，并表示計劃在明年初推出一個高通量 DNA 測序平臺。該公司還發布了一份 BioRxiv 預印本，詳細介紹了其新穎的合成測序方法，聲稱該方法可以將人類全基因組測序的成本降低到 100 美元，這可能成為因美納的 NovaSeq 高通量平臺帶來真正的競爭。
通過新的合作伙伴關系，該公司將把英偉達圖形處理單元嵌入到其 UG 100 高通量下一代測序儀器中，這些儀器目前處于早期測試階段。 英偉達A30 GPU 與英偉達的 Clara 人工智能計算平臺相結合，可加速對來自 UG 100 單元的數據進行一級和二級分析。
Ultima 表示，與 Google 的 DeepVariant 變體調用者單獨合作的模型可以在英偉達的 Clara Parabricks 平臺上運行，以進行進一步的二次分析。
“Ultima 的使命是不斷擴大基因組信息的規模，”Ultima 首席執行官 Gilad Almogy 在一份聲明中表示。 “我們獨特的架構通過結合多種技術進行擴展，因此我們很高興與英偉達合作，利用他們的 GPU 和 AI 加速平臺，為高質量排序和加速計算提供動力，從而降低客戶的總擁有成本。”
英偉達基因組學聯盟全球總監 George Vacek 表示，Ultima 合作展示了英偉達技術是如何設計用于加速大容量數據處理的。 “Nvidia GPU 在 UG 100 中提供了高度的板載計算能力，并且可以通過 Clara Parabricks 在下游加速數據分析，通過更高吞吐量和更低成本的分析實現大規模數據計劃，”他說。
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