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創新引領結構蛋白質組學的進步,創新支持大小分子多組學的一機式需求,創新拓展數據挖掘的縱深

2025.6.18

  ——專訪布魯克質譜業務高管:Rohan Thakur質譜業務總裁,Stefan Foser 全球制藥行業副總裁,Jeff李劍峰大中國區總經理

  多組學的需求是推動質譜技術進步最重要的增長動力。當高分辨高置信度地鑒定,高通量鑒定,單細胞多組學,空間組學的技術日臻完善后,一方面,質譜會趨向針對細分應用的專業化發展;另一方面,質譜還將繼續挑戰更高靈敏度、更高通量,并向著難度系數更高的結構蛋白質組學邁進。2025年ASMS,布魯克隆重發布了多項重量級新產品, 為全球科學工作者帶來了工具,加速科技發展。

  ?? timsOmni? 質譜儀:助力結構蛋白質組學研究

  ?? timsMetabo? 質譜儀:多組學利器,不僅在小分子代謝組學/脂質組學實現技術突破,同時與高靈敏度4D-蛋白組學分析無縫協同

  ?? timsUltra AIP質譜儀:解析微量樣本,適用于空間蛋白組學、單細胞蛋白組學、免疫肽組學及血漿蛋白組學

  ?? proteoElute? 納升液相色譜系統:無縫銜接 TIMS 質譜儀,賦能穩定可靠的高通量超高靈敏度多組學研究

  會場上,分析測試百科網采訪了布魯克質譜業務總裁 Rohan A. Thakur 博士、布魯克質譜全球制藥行業副總裁Stefan Foser和布魯克質譜大中國區總經理李劍峰,他們將共同為我們揭秘布魯克新品的創新價值、市場策略及布魯克的未來愿景。

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布魯克質譜業務高管:Rohan Thakur質譜業務總裁(右二)、Stefan Foser 全球制藥行業副總裁(左一)、Jeff李劍峰大中國區總經理(左二)和分析測試百科網總經理卞利萍(右一)

  Stefan介紹道:“本次ASMS期間,布魯克豐富的活動吸引了大量用戶的熱情參與:每日早餐研討會、eXceed專題研討會聚焦結構蛋白質組學、代謝組學等前沿領域,互動環節中科學家深入探討技術應用;儀器展示區設置實時演示,專家團隊現場解析原理并解答疑問。”李劍峰特別提到:“布魯克活動現場氣氛熱烈、座無虛席,觀眾的高參與度印證了技術的市場吸引力。”Rohan也總結道:“這次ASMS上發布兩款產品,完美覆蓋從小分子到大分子的組學分析,從量變到質變,是真正的創新,為科學家在組學科研的發展和突破提供更大可能性和潛力。”

重磅新品發布 四大技術突破

  在 2025 年 ASMS 展會上,布魯克推出四款重磅產品,帶來了激動人心的技術突破: timsOmni?質譜儀、timsMetabo?質譜儀、timsUltra AIP質譜儀和proteoElute?液相色譜系統。(詳情可參考:布魯克ASMS 2025創新發布

  timsOmni?質譜儀:開啟“蛋白質異質體組學”研究新紀元

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  timsOmni?是其最重磅的產品,它同時具備timsTOF的速度和性能以及新型Omnitrap的功能, 為科學研究、藥物研發、臨床研究及生物制劑高級質控等多個領域提供深度的完整生物大分子結構解析能力,可深入揭示功能性/病理性蛋白質異質體和寡核苷酸結構。timsOmni?平臺里程碑式的創新技術在于其多模態eXd捕獲技術,具備精準電子能量控制、離子累積和響應時間可調等特點。該系統同時支持碰撞誘導去折疊(CIU)技術,通過前端獲得蛋白變體CCS值信息,再結合多種電子解離(ECD和EID)與碰撞誘導解離(CID)技術,獲得豐富的結構信息。timsOmni?平臺還可以根據實驗需求,自定義組合多種碎裂方式,助力蛋白質組學研究人員和生物制劑科學家獲得更豐富的結構信息,位置信息,兼具高通量與高靈敏度。

  Stefan表示:“timsOmni?質譜儀將推動蛋白質組學的進一步發展,特別是在功能蛋白質組學領域。這意味著,我們有望通過蛋白質組分析精準識別藥物開發的目標,這無疑將為制藥行業和學術研究在理解疾病及藥物機制方面帶來新信息,新的視野,助力新藥研發的動力。“

  李劍峰指出:“timsOmni?既能進行傳統的bottom-up蛋白質組學分析,也能勝任結構蛋白質組學研究。在中國市場,目前95%的蛋白質組學客戶主要從事bottom-up研究,這是因為過去沒有更好的工具來支持結構蛋白質組學的需求。本次ASMS布魯克推出的timsOmni?正是解決這一問題的“正確工具”。我們的目標客戶主要是中國的大學研究平臺等,特別是那些原本做bottom-up的老師,他們希望獲得比傳統方法更精準的蛋白質修飾位點數據(如糖基化、磷酸化)。timsOmni?能提供這類高精度結構信息,支持蛋白組學研究的縱深發展。布魯克將繼續致力于:不斷發明最前沿工具,引領科學不斷向前。timsOmni?正是這一努力的體現,它支持科學向結構生物學、結構蛋白組學等前沿領域發展。這也是timsOmni?的定位和意義。”

  timsMetabo?質譜儀:四維破界,代謝革新!

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   timsMetabo? 質譜儀是新一代4D-多組學研究利器,不僅在小分子代謝組學/脂質組學實現技術突破,同時與高靈敏度4D-蛋白組學分析無縫協同,配備 TIMS-MX 新型離子淌度分析器、MoRE(Mobility Range Enhancement)技術拓展質荷比(m/z)和離子淌度范圍、QSee? 與 TwinScape? 數據全流程智能質控,實現了從分離效率、靈敏度、掃描速度到軟件質控系統的全方位升級,提供一站式精準解決方案。timsMetabo? 配備的 VIP-HESI雙離子源(兼容 ESI/APCI),靈敏度提升5倍以上, 創新 MoRE 掃描模式和 高達 300 Hz 的掃描速度,顯著提升化合物覆蓋度和鑒定深度,輕松應對微量與高通量應用場景。先進的捕集離子淌度分離技術 (TIMS) 能夠基于碰撞橫截面積(CCS),顯著增強同分異構體區分能力,實現復雜樣本精準鑒定。 timsMetabo? 完美繼承了 timsTOF 系列質譜在 高靈敏度4D-蛋白組學方面的研究優勢,并在微量樣本分析方法靈敏度進一步提升, 展現出同類產品難以比擬的性能優勢,為多組學融合分析開辟更高維度的科研通道。

  Stefan介紹到:“timsMetabo?質譜儀專為代謝組學設計,在與OmniScape和TwinScape?軟件結合使用時,展現出卓越的系統穩健性,還依托開發的新算法,顯著提升了化合物注釋的置信度。這意味著研究人員能夠生成并重復驗證數字代謝檔案,而這正是建立可靠生物樣本庫的基礎。生物樣本庫通常處理數百甚至數千個樣本,但每個樣本的可用量往往有限。因此,確保從有限樣本中獲取最精確、最全面的信息至關重要。通過結合TwinScape?+QSee?軟件,能夠實時監控儀器狀態,確保分析過程的穩健性,并憑借高置信度的注釋能力,在代謝組學領域發掘真正具有潛力的新型生物標志物。timsMetabo?利用了TIMS技術獨特的淌度分離能力,在小分子檢測靈敏度上實現了10倍提升,同時,得益于先進的離子傳輸(AIP)技術,在大分子蛋白質組學分析方面,其蛋白質鑒定數量也提高了20%。“

  李劍峰也補充說:”timsMetabo?能夠靈活應對小分子與大分子研究,一機兩用,極大提升了實驗室效率,特別適用于大學分析測試中心以及學科的中心實驗室。此外,其另一項突出優勢在于低樣本消耗:進樣量的降低,蛋白質鑒定數量仍然提升20%。這一突破性進展,使得從微量樣本中獲取豐富蛋白質信息成為可能,是質譜性能技術的一大飛躍。“

  timsUltra AIP 質譜儀:“超感”洞察,解析微量樣本奧秘

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  timsUltra AIP 質譜儀新增的一個Athena離子處理器(AIP),進一步提高了靈敏度。該技術可增強碎片離子的轉移,并優化了正交TOF對MS/MS碎片離子的最優采集。它適用于非常少量的樣本,在需要最高靈敏度的蛋白質組學研究中,肽段鑒別數量提升超過35%,蛋白質鑒定數量提升20%。

  proteoElute?新一代納流液相色譜系統:為蛋白質組學提供更靈敏更穩健的解決方案

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  proteoElute?納流液相色譜系統完美適配單細胞蛋白質組學、免疫肽段組學、微生物分析等多種應用場景,即使在處理微量或復雜的生物樣本時也能確保可靠性能。 proteoElute?搭載了TwinScape?技術,可實時監控系統狀態并運行背景診斷。這種前瞻性維護機制能主動預警潛在問題,讓樣本量較少的實驗過程全程無憂。 為追求極致可靠性,該系統配備生物相容性陶瓷閥、新型多孔金屬過濾器及專利捕集柱,協同提升色譜性能。新型進樣器與針式清洗系統將殘留降低3倍,這對超低樣本量分析中規避背景信號干擾至關重要。

  李劍峰介紹,proteoElute?高達70%的零部件均為全新設計。其核心優勢正是聚焦于提供無與倫比的穩定性和精確的重現性,滿足前沿科研對可靠性的嚴苛要求。

  Stefan和李劍峰還告訴布魯克的用戶們一個好消息:布魯克的設備具有升級的可能性。客戶可根據應用需求或實驗室需要選擇購買或升級不同靈敏度的設備,配套的解決方案都已發布。

timsOmni?創新技術詳解

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timsOmni?結構示意圖,放大區是Omnitrap

  “timsOmni?瑞士軍刀般的靈活性來源于Omnitrap。”李劍峰說到,“Omnitrap有九個線性離子阱,中間有三個離子阱,包含碰撞誘導解離(CID)碰撞池和能量可變的eXd捕獲碰撞池,以及碎片離子在Q8的富集并且回傳功能,可循環返回CID或eXd模塊進行多次迭代碎裂(如MSn級聯分析),支持多種碎裂和富集模式的自由組合。通過豐富多樣的組合應用方案處理后的離子,流經多極桿聚焦,由AIP再次優化聚焦后,精準抵達TOF檢測器完成高精度分析。其科學研究的無限拓展性,可能性,完全取決于科學家的方案設計和研究領域。”

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Omnitrap示意圖

  timsOmni?結合了多項技術,讓我們深刻體會到質譜內部變化的奧妙,正是這些變化,使timsOmni?可產生多種工作模式,更深度地剖析蛋白質結構。

  從結構示意圖上可以看到,離子從離子源和離子透鏡組進入后,到達雙TIMS分離部分(Dual TIMS analyzer),TIMS 提供精確 CCS 值,可解析構象的異構性。

  離子進一步通過傳輸多極桿后,進入四極桿選擇母離子,接下來送入Omnitrap,可以進行多種模式的碎裂,包括CID、eXd和MSn碎裂。大家比較熟知的傳統的CID碰撞誘導解離,那eXd有什么作用呢?

  在 eXd 捕獲模式下,前體離子被捕獲并在電子輻射下快速碎裂。通過調整捕獲時間,可顯著提升碎片產率,優化前體離子消耗率(> 90%)。timsOmni? 能夠精確調諧電子能量,從而探索多種碎裂模式,并靈活調整 eXd 反應時間以獲取理想結果。憑借獲取的完整電子碎裂譜圖,可以設計全新的解決方案,以實現深度測序和詳細的結構解析。

  像離子阱質譜一樣, 通過Omnitrap可進行多維度 MSn 分析和離子富集,提供無與倫比的全掃描 MS 和 MSn 靈敏度,即使對于豐度極低的離子也能顯著放大信號。

  得益于多級 MSn eXd 工作流程,通過精確控制離子束,任意強度的離子均可被靶向進行電子誘導解離。因此,對于完整蛋白進行精確、接近于100%的碎裂變得可能,完整蛋白質表征分析,翻譯后修飾表征,蛋白質復合物的深度測序,抗體互補決定區測序等各種結構蛋白質組學研究的大門,正在由timsOmni開啟。正如烏得勒支大學化學和制藥科學杰出教授,荷蘭烏得勒支荷蘭蛋白質組學中心科學主任Albert Heck 博士所說:“借助timsOmni,蛋白質組學終將實現‘以蛋白為中心’的轉變。”

  Stefan介紹說,timsOmni?質譜系統的創新架構將開啟全新的應用維度。我們可根據具體研究需求,靈活組合不同應用策略——例如在結構蛋白質組學研究中,通過tims的精準電荷分離結合四極桿的碰撞活化,實現對完整蛋白質及其翻譯后修飾的完整表征。得益于我們遍布全球學術界的專家合作網絡,該系統已在藥物研發領域展現出顯著價值:從蛋白質構象動態分析到疾病標志物發現,其應用場景正持續拓展。當前我們的研發重點,正是基于timsOmni平臺持續開發面向精準醫學和生物制藥的創新解決方案。

neofleX?質譜儀

  談到布魯克去年推出的neofleX?質譜儀, 李劍峰表示,neofleX?作為布魯克MALDI質譜儀中的中端產品,技術性能與rapifleX?基本相同,首次將高性能的MALDI-TOF/TOF設計為緊湊的臺式儀器,面向更廣泛的用戶群體。在中國市場一經推出即廣受歡迎。neofleX?的應用領域廣泛,新材料、半導體、新能源電池等市場亦有很大潛力。布魯克的責任是拓展更多的應用,并在全球范圍內分享,幫助客戶更好地使用這個產品。

  Stefan補充到:從全球視角來看,布魯克在MALDI技術領域始終占據領先地位。隨著neofleX?臺式MALDI質譜的推出,進一步擴展了上述優勢。neofleX?不僅保留了核心性能,更以緊湊設計賦予用戶前所未有的靈活性。例如,研究人員可借助neofleX?開展組織成像研究,并實現與脂質組學或代謝組學的聯合分析;在非成像領域,neofleX?同樣支持蛋白質表征等前沿應用。相信臺式的MALDI質譜將激發用戶重新思考MALDI技術的潛力,推動其在生命科學、臨床診斷及工業分析等領域釋放更大價值。

空間蛋白質組學和技術趨勢

  2019年隨著timsTOF fleX的推出,布魯克首次提出了空間定位組學(SpatialOMx?)的概念,今日已演變為空間蛋白質組學,而空間蛋白質組學被評為《Nature Method》2024年的年度方法。李劍峰強調了布魯克在空間蛋白質組學方面的優勢:timsTOF質譜具有超高靈敏度和超低樣本消耗能力(pg量級),這對樣本極其有限的空間組學(單細胞、微量組織)至關重要。此外,MALDI成像提供微米級空間分辨率(如5 μm),結合激光切割顯微捕獲和timsTOF分析,通過統一軟件平臺實現數據的無縫鏈接,提供了比同行應用方式更靈活、應用面更廣的解決方案。

  Stefan補充道,這些被實際應用的系統具有速度和穩定性優勢。例如,timsUltra AIP現在可以每天處理高達500個樣本,在2.5分鐘內完成低單體量的分析。布魯克從MALDI到timsTOF的產品系列非常豐富,能服務于制藥行業從早期發現到候選藥物優化的整個鏈條。

  針對未來幾年的質譜技術,Stefan表示,從工具的角度來看,布魯克已提供了更靈敏、更強大的工具。用戶需求方面,未來將更關注數據處理和軟件等方面,用戶希望利用軟件提取更豐富的信息,而不僅是蛋白質的鑒定列表,因此布魯克將繼續優化軟硬件設計,幫助用戶提取具有生物學意義的關鍵信息。李劍峰補充道,當前質譜研究正從傳統的Bottom-up分析向結構蛋白組學轉型。布魯克推出的 timsOmni? 平臺已為未來 5 年的技術趨勢指明了方向。

兩種創新方式驅動增長

  2024年布魯克營業收入有機增長13.6%,連續多年保持兩位數增長。談及原因Stefan表示:“這是因為布魯克永遠追求真正的創新。” 正是由于創新,布魯克能為科學家們展現更廣闊的生物學視野,比如之前可研究20,000個基因,現在能研究數百萬蛋白質、異構體及單細胞的功能。

  李劍峰也說到:13.6%的有機增長代表了跨部門的集團合作的結果,但正如Stefan所說,關鍵在于如何理解創新。創新來源于對于解決方案組合的升級需求:提供更先進的方案,提供更全面的一攬子方案。有兩種方式可以選擇:自主研發創新技術或收購新技術/公司以填補產品組合空白。通過創新驅動,布魯克始終保持在技術的前沿,支持客戶并驅動增長。

  生命科學領域的收購

  在生命科學領域,布魯克近年來開展了多項并購及合作,豐富了其蛋白組學和代謝組學的產品線,為質譜用戶創建解決方案。

  樣本制備技術公司PreOmics是布魯克的合作伙伴,布魯克持有其90%以上的股份。PreOmics的BeatBox平臺技術實現了蛋白質組學樣本處理的自動化和高通量,為布魯克的用戶提供高質量的樣本制備解決方案,確保蛋白質組學研究的高效和可重復性。

  2023年1月,布魯克與總部位于瑞士的Biognosys達成戰略合作關系,結合了Biognosys先進的CRO服務和Spectronaut?軟件工具。Stefan介紹,Biognosys為合作伙伴提供的服務,比如CRO業務,展示了從頭到尾的解決方案,他們可以在復雜的研究項目中進行測試,還可以通過自身創新豐富產品線。

  在ASMS 2025期間,布魯克宣布收購了奧地利代謝組學公司Biocrates。此次收購增強了布魯克基于質譜的代謝組學產品,并支持其繼續向多組學領域的擴展。

  通過創新和收購合作,布魯克不僅擴展了其產品組合,構建了一個從樣本制備到數據分析的完整生態系統,還保持了持久的增長活力。

全球和本土化戰略

  Stefan表示:從全球戰略視角來看,布魯克致力于在全球范圍內拓展知識網絡,尤其在學術領域推動技術與研究的深度擴展,并通過實質性的業務增長,進一步推動醫藥領域相關技術的應用、普及與創新。具體而言,布魯克希望通過強化對復雜研究的投入,加深醫藥界在疾病理解及藥物開發中的應用與認知,進而推動和加速醫藥研發,為人類的健康福祉做出貢獻。

  近年來,布魯克質譜在中國的表現突出,達到20%以上的增長。李劍峰表示,這得益于布魯克創新技術在市場中的發展潛力,尤其是在目前中國相對較小的市場體量下,增長空間和機會更大。

  李劍峰談到中國近期的戰略時表示,首先要增加市場覆蓋率。此前,布魯克因設備高精尖、團隊規模較小、產品定價較高等因素,市場覆蓋存在一定局限性。因此要增加地域覆蓋率,加強在二線城市及高校的布局;同時要增加行業覆蓋率,向食品安全、海關等多行業延伸。其次是平衡創新領先性與市場適配性。布魯克推出的創新通常領先當前市場兩三年,“我們將致力于,讓布魯克創新的技術以更貼合本土需求的方式傳遞給中國的客戶,不僅滿足客戶現有的需求,更要通過技術引領市場趨勢。“李劍峰說道,“相信通過落實這些戰略,將有效構建在中國市場的差異化競爭力,驅動業務持續增長,實現全球戰略與本土市場需求的深度融合。”

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