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GB/T 40226-2021
環(huán)境微生物宏基因組檢測(cè) 高通量測(cè)序法

Detection of environmental microbial metagenome—High throughput sequencing

GBT40226-2021, GB40226-2021


標(biāo)準(zhǔn)技術(shù)框架解析

核心要素 技術(shù)要求 創(chuàng)新點(diǎn)
樣品采集 三類環(huán)境樣本（糞便/土壤/水體）獨(dú)立規(guī)范 首次建立常溫穩(wěn)定劑保存方案
DNA質(zhì)控 Q20≥90%、Q30≥80% 引入完整性圖譜分級(jí)系統(tǒng)
數(shù)據(jù)量 ≥1×107條有效序列 明確最低檢測(cè)閾值

關(guān)鍵技術(shù)指標(biāo)詳解

儀器設(shè)備要求

標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定必須使用高通量測(cè)序儀、冷凍離心機(jī)（≥12000g）等核心設(shè)備，其中：

  • DNA提取階段：需配備紫外分光光度計(jì)進(jìn)行濃度檢測(cè)
  • 建庫階段：要求PCR儀控溫精度±0.5℃
  • 保存條件：-80℃低溫冰箱需具備溫度報(bào)警功能

實(shí)施建議

實(shí)驗(yàn)室建設(shè)方案

  1. 分區(qū)管理：嚴(yán)格區(qū)分試劑準(zhǔn)備區(qū)、樣本處理區(qū)、擴(kuò)增區(qū)
  2. 氣流控制：采用單向氣流避免交叉污染
  3. 質(zhì)控節(jié)點(diǎn)：設(shè)置DNA提取、文庫構(gòu)建、數(shù)據(jù)產(chǎn)出三階段QC

數(shù)據(jù)庫應(yīng)用策略

推薦優(yōu)先使用CNCB/NGDC等國(guó)內(nèi)數(shù)據(jù)庫，國(guó)際數(shù)據(jù)庫作為補(bǔ)充驗(yàn)證。注釋時(shí)應(yīng)注明：

  • 數(shù)據(jù)庫版本及更新時(shí)間
  • 相似度閾值設(shè)置（≥95%）
  • 覆蓋度要求（≥90%）

標(biāo)準(zhǔn)演進(jìn)分析

本標(biāo)準(zhǔn)較傳統(tǒng)培養(yǎng)法具有三大突破：

比較維度 傳統(tǒng)方法 本標(biāo)準(zhǔn)方法
檢出率 ＜1%可培養(yǎng)微生物 ＞90%群落物種
周期 2-4周 3-5工作日
數(shù)據(jù)維度 單一菌落信息 物種+功能基因+代謝網(wǎng)絡(luò)

 

請(qǐng)注意，本內(nèi)容不等同于標(biāo)準(zhǔn)原文，內(nèi)容僅供參考，本站不保證內(nèi)容的正確性。準(zhǔn)確、完整的信息請(qǐng)參閱正式版文本。

 

 

GB/T 40226-2021

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標(biāo)準(zhǔn)號(hào)
GB/T 40226-2021
別名
GBT40226-2021
GB40226-2021
發(fā)布
2021年
總頁數(shù)
20頁
發(fā)布單位
國(guó)家質(zhì)檢總局
當(dāng)前最新
GB/T 40226-2021
 
 
引用標(biāo)準(zhǔn)
GB 19489 GB/T 35537-2017 GB/T 6682

本文件描述了采用高通量測(cè)序技術(shù)進(jìn)行環(huán)境微生物宏基因組檢測(cè)的術(shù)語和定義、原理、試驗(yàn)條件、試劑、儀器設(shè)備、樣品、試驗(yàn)步驟、試驗(yàn)報(bào)告和質(zhì)量控制要求。 本文件適用于運(yùn)用高通量測(cè)序法進(jìn)行環(huán)境微生物宏基因組的檢測(cè)。

術(shù)語 
環(huán)境 Environment
相對(duì)豐度 Relative abundance

GB/T 40226-2021 中提到的儀器設(shè)備

PCR儀 用于擴(kuò)增特定的DNA片段的設(shè)備。
冷凍離心機(jī)
最大離心力12000 g以上		用于分離生物樣本中的不同組分。
高通量測(cè)序儀 用于大規(guī)模并行分析DNA序列的技術(shù)平臺(tái)。

專題

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