本標準規定了直接飼喂微生物和發酵制品類飼料添加劑生產菌株的分子生物學鑒定方法,包含兩大技術體系:
方法類型 | 技術原理 | 適用范圍 | 判定閾值 |
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ANI鑒定法 | 全基因組比對計算平均核苷酸一致性 | 已批準/申報菌株 | ANI>96%為同種 |
基因序列法 | 16S rRNA/gyrB/pheS基因測序 | 附錄A所列菌種 | 16S>98.65%或gyrB>97% |
典型鑒定流程示例:
設備類型 | 技術參數 | 質量控制 |
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高通量測序儀 | 讀長≥150bp | 符合GB/T 27403 |
PCR儀 | 溫控精度±0.5℃ | 定期校準 |
本標準首次將第三代測序技術納入飼料微生物鑒定體系,相比傳統表型鑒定方法具有三大優勢:
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本文件描述了直接飼喂微生物飼料添加劑菌株和發酵制品類飼料添加劑生產菌株中細菌菌種的分子生物學鑒定方法,包括平均核苷酸一致性( ANI)鑒定法和基因序列鑒定法. 本文件平均核苷酸一致性( ANI)鑒定法適用于已批準或擬申報的直接飼喂微生物飼料添加劑菌株和發酵制品類飼料添加劑生產菌株中細菌菌種的鑒定. 基因序列鑒定法適用于附錄A中所列細菌菌種的鑒定.
術語 | |
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直接飼喂微生物飼料添加劑 | Direct-fed microbial feed additives |
發酵制品類飼料添加劑 | Fermented product feed additives |
菌種鑒定 | Species identification |
測序深度 | Depth of sequencing |
疊連群 | Contig |
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