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DNA電泳帶型分析

關(guān)鍵詞: DNA電泳帶型分析來源: 互聯(lián)網(wǎng)

DNA電泳需要進行帶型分析,在實驗過程中常會發(fā)現(xiàn)所得的帶型出現(xiàn)在這樣那樣的問題。在此,對DNA帶型做了相應(yīng)的分析。帶型原因分析解決辦法弱帶或無帶上樣的DNA量不夠增加DNA的上樣量,聚丙烯酰胺凝膠電泳比瓊脂糖電泳靈敏度稍高DNA降解避免DNA。

帶型 原因分析 解決辦法
弱帶或無帶 上樣的DNA量不夠 增加DNA的上樣量,聚丙烯酰胺凝膠電泳比瓊脂糖電泳靈敏度稍高
DNA降解 避免DNA的核酸酶污染
電泳時間過長,DNA跑出 減短電泳時間,降低電壓,增強凝膠濃度
EB染色的DNA,紫外光源不合適 應(yīng)用短波長(254 nm),增強紫外燈靈敏度
DNA帶缺失 小DNA帶走出凝膠 減短電泳時間,降低電壓,增強凝膠濃度
分子大小相近的DNA帶不易分辨 增加電泳時間,核準(zhǔn)正確的凝膠濃度
DNA 變性 電泳前請勿高溫加熱DNA鏈,以20 mM NaCl Buffer稀釋DNA
巨大DNA鏈,凝膠電泳不合適 在脈沖凝膠電泳上分析
DNA帶模糊 DNA降解 避免核酸酶污染
DNA上樣量過多 減少凝膠中DNA上樣量
所用電泳條件不合適 電泳時電壓不應(yīng)超過20 V/cm,溫度<30℃,巨大DNA鏈,溫度應(yīng)<15℃,核查所用電泳緩沖液是否有足夠的緩沖能力
DNA樣含鹽過高 電泳前通過乙醇沉淀去除過多的鹽
有蛋白污染 電泳前酚抽提去除蛋白
DNA變性 電泳前勿加熱,用20 mM NaCl緩沖液稀釋DNA
不規(guī)則DNA帶遷移 對于λ/Hind III片段COS位點復(fù)性 電泳前加熱DNA 65℃加熱5-10分鐘,然后在冰上冷卻5分鐘
電泳條件不合適 電泳電壓不超過20 V/cm,溫度<30℃,電泳緩沖液有足夠的緩沖能力
DNA變性 以20 mM NaCl Buffer稀釋DNA,電泳
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